Презентация - Что нового мы узнали о флоре россии благодаря inaturalist?

Что нового мы узнали о флоре России благодаря iNaturalist? Серегин Алексей Петрович, доктор биологических наук, кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, botanik.seregin@gmail.com V (XIII) Международная ботаническая конференция молодых учёных в Санкт-Петербурге (25—29 апреля 2022 г., Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН) 25.04.2022 г.
Приглашенный доклад

16.09.2021
23.04.2022

23.04.2022

9.01.2019

23.04.2022

Сотрудники БИН РАН на iNaturalist

8.02.2019 1,5 тыс. наблюдений
2.07.2020
21.11.2021 140 тыс. наблюдений
7.07.2021

Что нового: сюжет №1
Нейронная сеть узнает около 4 000 видов флоры России

Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные рядом (по умолчанию).
Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом.
Вариант 3. Точка не указана.
16.10.2021

Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные рядом (по умолчанию).
Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом.
Вариант 3. Точка не указана.
Бесплатное расширение для Chrome
20.11.2021

58° с.ш.
-.-.-.-.-
-.«увиденные поблизости».«увиденные поблизости».«увиденные поблизости».-
-.«увиденные поблизости».находки.«увиденные поблизости».-
-.«увиденные поблизости».«увиденные поблизости».«увиденные поблизости».-
-.-.-.-.-
57°
56°
55°
54°
35° 36° 37° 38° 39° в.д.
53°

Май -.Июнь «увиденные поблизости».Июль Находки.Август Находки.Сентябрь Находки.Октябрь «увиденные поблизости».Ноябрь -

Число видов в наборе для обучения
Число обучающих снимков
8.10.2021
Седьмая модель: 25 млн фото, 47 тыс. видов (план) 27 млн фото, 55 тыс. видов (факт) Внедрена 12.04.2022
8.10.2021

Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные рядом (по умолчанию): шестая модель
Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные рядом (по умолчанию): седьмая модель
24.04.2022

Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом: шестая модель
Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом: седьмая модель
24.04.2022

Параметры проекта по флоре России и двух моделей
Шестая модель
Седьмая модель (план)
Проект: 7 407 видов флоры России 1 225 000 наблюдений Модель: Покрывает 2 680 видов (36%) Покрывает 94,5% наблюдений
Проект: 7 560 видов флоры России 1 515 817 наблюдений Модель: Покрывает 3 149 видов (42%) Покрывает 96,1% наблюдений
7.10.2021

Региональные параметры моделей для флоры России: охват видов
Шестая модель
- Седьмая модель (план)
Алтайский край: 75,6 - 81,0 Брянская область: 91,9 - 92,6 Дагестан: 49,5 - 55,3 Иркутская область: 67,7 - 74,7 Камчатка: 64,0 - 70,6 Краснодарский край: 68,3 - 73,6 Красноярский край: 62,0 - 68,8 Крым: 65,8 - 72,2 Москва: 90,1 - 89,9 Приморский край: 46,2 - 53,3 Республика Алтай: 57,0 - 65,0 Свердловская область: 82,1 - 84,0 Максимальный прирост по доле потенциально узнаваемых видов будет по Республике Алтай (+8,0% видов), Приморскому краю (+7,1% видов) и Иркутской области (+7,0% видов).
7.10.2021

Региональные параметры моделей для флоры России: охват наблюдений
Шестая модель
- Седьмая модель (план)
Алтайский край: 92,9 - 95,2 Брянская область: 99,3 - 98,9 Дагестан: 61,1 - 68,6 Иркутская область: 89,0 - 94,2 Камчатка: 82,4 - 89,6 Краснодарский край: 83,7 - 89,6 Красноярский край: 75,5 - 80,7 Крым: 83,4 - 92,1 Москва: 99,7 - 99,1 Приморский край: 52,7 - 64,3 Республика Алтай: 76,6 - 85,5 Свердловская область: 97,4 - 97,9 Максимальный прирост по доле потенциально узнаваемых наблюдений будет по Приморскому краю (+11,6% наблюдений), Республике Алтай (+8,9% наблюдений) и Крыму (+8,7% наблюдений).
7.10.2021

Что нового: сюжет №2
Принципиально новый источник принципиально новых данных по флоре России

Табличная выгрузка (максимум 200 000 строк) легко обрабатывается в MS Excel

20.11.2021
20.11.2021
20.11.2021
15.01.2022

Данные iNaturalist (слева) и Гербария МГУ (справа) по флоре России: самые популярные виды
21.11.2021

Что нового: сюжет №3
Охраняемые виды растений

23.04.2022

23.04.2022

Что нового: сюжет №4
Вымирание видов

Все сосудистые растения
Taraxacum officinale (одуванчик лекарственный)
Флора Москвы: 1 933 Флора Подмосковья: 1 037
Флора Москвы: 135 000 Флора Подмосковья: 144 000
1,5x1,5 км
21.11.2021

Один экземпляр снят двумя людьми независимо друг от друга с разницей в три часа (окрестности Зеленоградска Калининградской области)

Pedicularis palustris L. (мытник болотный) в Подмосковье: регресс
Данные гербариев: 122 точки
Данные iNaturalist: 7 находок (4 точки)
23.04.2022

Документация вымирания: Lycopodium clavatum L. (плаун булавовидный)
11 точек на iNaturalist
47 гербарных образцов
23.04.2022

Документация вымирания: Lycopodium clavatum L. (плаун булавовидный)

Документация вымирания: Antennaria dioica (L.) Gaertn. (кошачья лапка)
93 гербарных образца
13 точек на iNaturalist
23.04.2022

Что нового: сюжет №5
Расселение видов. Адвентивные виды

Viscum album (омела белая)

Натурализация Lonicera nigra (жимолости чёрной) близ Санкт-Петербурга
80 точек

Натурализация Clematis terniflora (ломоноса трёхцветкового) близ Новосибирска
7 точек
21.11.2021

Данные по 10 самым распространенным адвентивным растениям флоры России, доступные в GBIF и поступающие в GBIF из iNaturalist (все годы)
№ п/п.Вид.GBIF, число записей.iNaturalist, число записей.Доля iNaturalist, %
1..Heracleum sosnowskyi.17399.6107.35,1
2..Acer negundo.11959.9883.82,6
3..Erigeron canadensis.6068.4673.77,1
4..Impatiens glandulifera.5693.3765.66,1
5..Impatiens parviflora.5096.3892.76,4
6..Lupinus polyphyllus.4796.3721.77,6
7..Matricaria discoidea.4562.2947.64,6
8..Erigeron annuus.4030.3276.81,3
9..Bidens frondosa.3367.2674.79,4
10..Solidago canadensis.3026.2681.88,6
13.01.2022

Данные по 10 самым распространенным адвентивным растениям флоры России, доступные в GBIF и поступающие в GBIF из iNaturalist (за 2020 и 2021 гг.)
№ п/п.Вид.GBIF, число записей.iNaturalist, число записей.Доля iNaturalist, %
1..Acer negundo.8353.7998.95,8
2..Heracleum sosnowskyi.4457.4453.99,9
3..Impatiens glandulifera.4062.3000.73,9
4..Erigeron canadensis.3859.3841.99,5
5..Impatiens parviflora.3765.3180.84,5
6..Lupinus polyphyllus.3053.2875.94,2
7..Matricaria discoidea.2495.2399.96,2
8..Erigeron annuus.2457.2395.97,5
9..Bidens frondosa.2166.2153.99,4
10..Solidago canadensis.2108.2088.99,1
13.01.2022

Что нового: сюжет №6
Региональные флоры

Сеточное картирование флоры Владимирской области: районы
Распространение Alnus glutinosa

Разрешение метода: точка в центре квадрата

Разрешение: реальные координаты (5–10 м)

21.11.2021

20.03.2021

Что нового: сюжет №7
Отслеживание номенклатурных изменений в фоновом режиме

Что нового: сюжет №8
Автор карты С.В. Дудов, 13 апреля 2022 г.
Сеточное картирование флоры России: принципиальная возможность

18.04.2022

0.20 to 0.50
Порог 0,20 от богатства флор в 10 000 кв. км (по Малышеву, 1992) Квадраты 100x100 км Около 6400 видов
Автор карты С.В. Дудов, январь 2022 г.

Все данные (обрезка по 20%)
«Флора России» на iNaturalist
Гербарий МГУ в GBIF
Плотность населения России

тундры
шир.-листв. леса
лесостепь
тайга
подтайга
степи и южные горы
горы юга Сибири
Метрика Ward, семь кластеров Квадраты 100x100 км, порог 20%
Автор карты С.В. Дудов, январь 2022 г.

Алтай/Саяны vs. Прибайкалье
Юг Дальнего Востока
Охотия
Кольский полуостров
Кавказ
Метрика Ward, 15 кластеров Квадраты 100x100 км, порог 20%
Автор карты С.В. Дудов, январь 2022 г.

Проекция Меркатора, квадраты 16 пропусков ок. 270 x 270 км

18.04.2022

Все источники по флоре России, квадраты 100 x 100 км
8 кв 95 кв
Всего 2035 квадратов
Автор карты С.В. Дудов, 13 апреля 2022 г.

Что нового мы узнали о флоре России благодаря iNaturalist? Серегин Алексей Петрович, доктор биологических наук, кафедра экологии и географии растений биологического факультета МГУ, botanik.seregin@gmail.com 25.04.2022 V (XIII) Международная ботаническая конференция молодых учёных в Санкт-Петербурге (25—29 апреля 2022 г., Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН) Спасибо за внимание!
Приглашенный доклад